«Отряд Тактической Борьбы с Цифровыми Авариями» (ОТСЦА) – правительственная организация, в состав которой входят Масару Даймон, Агумон, Тоума Норштейн, Гаомон, Йошино «Йоши» Фудзиэда, Лаламон, Кинан Крайер и Фалькомон. Задача организации – возвращать дигимонов в Цифровой Мир.
Масару узнаёт, что Меркуримон враждебен человечеству. Выясняется, что учёный Акихиро Курата некогда вторгся в Цифровой Мир. Курата заручился поддержкой правительства, убедив их в том, что все дигимоны представляют угрозу для людей. Курата освобождает и пробуждает Белфемона, одного из Семи Великих Повелителей Демонов, а затем сливается с ним. Масару удаётся победить их. Перед смертью Курата взрывает бомбу, которая запускает процесс слияния Цифрового Мира с человеческим. БанчоЛеомон предотвращает столкновение миров, но просит Масару остановить Короля Дрезила (Иггдрасиль), верховного правителя, который пытается защитить Цифровой Мир, уничтожив человечество, поскольку оба мира не могут существовать в одном измерении. Масару понимает, что его отец, Спенсер, десять лет был заперт в Цифровом Мире, потому что Дрезил завладел его телом, а БанчоЛеомон сохранил его душу. После того, как Масару уничтожает Дрезила, душа Спенсера возвращается в его тело.
Оба мира восстановлены, и все дигимоны-партнёры возвращаются домой. Пять лет спустя Масару и его друзья строят своё будущее.