L'équipe SWAT fait face à de nouveaux défis alors qu'elle lutte pour protéger Los Angeles de menaces toujours plus dangereuses.
La sixième saison de SWAT: Police d'élite suit le sergent Daniel "Hondo" Harrelson et son équipe d'élite alors qu'ils entreprennent des missions intenses à Los Angeles et au-delà. Cette saison démarre avec l'équipe se rendant en Thaïlande pour collaborer avec les forces spéciales locales, où ils se retrouvent mêlés à une enquête sur un vaste réseau de trafic d'héroïne.
De retour chez eux, les agents doivent faire face à des criminels menaçants, allant de barons de la drogue vengeurs à des terroristes domestiques. Hondo doit également jongler avec sa vie personnelle et professionnelle, car il s'apprête à accueillir un nouvel ajout à sa famille. Les membres de l'équipe, tels que Deacon, Street, Luca, et Tan, sont confrontés à des dilemmes personnels qui mettent à l'épreuve leur loyauté et leur courage.